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南丹麦大学(SDU)临床研究系病理学研究组下属的分子骨组织学(Molecular Bone Histology, MBH)实验室,现面向精准医学整合多组学中心(Center for Integrated Multi-omics in Precision Medicine, CIMP)和丹麦空间成像联盟(Danish Spatial Imaging Consortium, DanSIC)联合招聘一名全职研究助理或博士后研究员(每周工作37小时)。
该职位为期一年,期满后有机会续聘。
对于研究助理岗位,若候选人处于合适的职业阶段并有进一步深造的意向,未来可能有机会转为攻读博士学位。我们将优先考虑能力与岗位最匹配的候选人,不论其职业阶段,诚邀一位技术扎实、充满动力的生物信息学专家加入我们的团队。
关于我们
CIMP 是南丹麦大学(SDU)与欧登塞大学医院(OUH)共同设立的重点研究中心,致力于通过整合多组学技术,为骨质疏松症、乳腺癌和多发性硬化症患者提供个性化、精准化的降阶梯治疗方案,以避免过度治疗。中心由 Vijay Tiwari 教授、Mads Thomassen 教授、Richard Röttger 教授、Zsolt Illes 教授以及 Thomas L.G. Andersen 教授共同领导。其中,Thomas L.G. Andersen 教授负责空间转录组学方向,并专注于骨质疏松症治疗研究。
DanSIC 由 Thomas L.G. Andersen 教授领导的分子骨组织学(MBH)实验室负责运行。MBH实验室的总体目标是促进对骨骼、骨骼疾病及其治疗的深入理解。DanSIC的使命是通过创新的成像技术与生物信息学方法,推动空间生物学领域的发展,提供尖端解决方案,使研究人员能够在保持空间背景的前提下,以前所未有的分辨率探索复杂的生物系统。DanSIC同时也是CellX(丹麦单细胞研究平台)的一部分,该平台包含一个专注于空间生物信息学的学术社区。
研究任务作为CIMP与DanSIC联合聘用的研究助理或博士后,您将在分析和解读多项临床试验产生的大规模空间转录组数据方面发挥关键作用。您将与跨学科的科学家和临床医生团队合作,开发生物信息学分析流程与工具,以促进对临床样本空间图谱的理解。您将主要处理来自10x Genomics公司的Xenium高通量单细胞空间图谱(HSSP)平台和NanoString Bruker公司的GeoMx数字空间图谱平台产生的数据集,并计划拓展至其他空间技术。我们的研究项目涵盖多个领域,您的专业知识将为骨质疏松症、乳腺癌、多发性硬化症及其他疾病的突破性研究做出贡献。
空间生物信息学专员的主要职责包括:
为DanSIC和CIMP的空间图谱研究开发、实施并维护空间生物信息学分析流程。
与内部及外部研究人员合作,设计实验方案并分析复杂数据集。
进行统计分析和数据可视化,以解读复杂数据并撰写发表成果。
将空间生物信息学分析整合到CIMP的多组学分析流程中。
撰写报告、制作演示文稿和学术手稿,与科学界同行交流。
持续跟进空间生物信息学领域的最新进展。
协助完成CIMP和MBH实验室内部进行的表观遗传学分析。
2. 您的个人资料
申请人须拥有生物信息学、计算生物学等相关领域的硕士学位(如申请研究助理岗位)或硕士及博士学位(如申请博士后岗位),或能证明具备相关领域的研究经验。申请人应在以下一个或多个领域/方面具备经验:
熟练掌握Python或R等编程语言。
具有使用生物信息学工具和软件进行数据分析的经验(例如Seurat, SquidPy, Bioconductor)。
扎实的统计学方法和数据可视化技术知识。
熟悉空间转录组技术和生物数据解读者优先。
熟悉优化细胞分割算法以提高准确性和效率,并有使用Cellpose, DeepCell或Baysor等工具/软件包经验者优先。
出色的解决问题能力和团队协作能力。
优秀的英语书面及口头沟通能力。
有指导本科、硕士或博士生经验者优先。
有科研项目管理经验者优先。
如需了解更多信息,请联系DanSIC-MBH实验室负责人Thomas Levin Andersen教授。邮箱:thomas.levin.andersen@rsyd.dk电话:+45 22284772
薪资与聘用条款将按照丹麦财政部与AC(丹麦专业协会联合会)达成的协议执行。
4. 申请要求
申请必须通过点击下方“立即申请”链接在线提交。我们强烈建议您在申请前阅读《如何在南丹麦大学申请职位》。
我们只接受英文申请材料。申请材料须包括以下PDF文件(请注意,动机信和个人简历的总大小不得超过10MB):
动机信
详细个人简历
学位证书:硕士学位证书(研究助理岗位)及博士学位证书(博士后岗位)
已发表成果的完整编号列表
申请博士后岗位者:需提供其认为与该职位最相关的3篇经同行评审的科学出版物。请注意,每篇出版物需以PDF附件形式提交,允许将所选出版物合并为一个PDF文件。
研究经验描述
与职位相关的其他资质说明
如遇技术问题,请联系:hcm-support@sdu.dk请注意,以上所有信息必须包含在申请材料中。截止日期之后提交的申请和/或不完整的申请将不予考虑。
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https://www.researchgate.net/job/1034622_Research_Assistant_or_Postdoc_in_Spatial_Bioinformatics